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Endocardite et bactériémie à S. aureus

InfectiologieFiche révisée · 22 oct. 2026

💊 Doses / traitement✉️ Signaler une erreur

En bref : Une hémoculture positive à S. aureus n’est jamais un contaminant. Quatre gestes changent le pronostic : consultation en infectiologie, hémocultures de contrôle à 48 h, échographie cardiaque pour tous et contrôle de la source (retrait du cathéter, drainage). Pour le SASM, la céfazoline est maintenant le 1er choix ; pour le SARM, la vancomycine. Durée minimale de 14 jours IV à partir de la 1re hémoculture négative ; 4 à 6 semaines si foyer profond ou endocardite.

🩺 Au chevet

🚩 Signaux d’alarme

  • Toute hémoculture positive à S. aureus, même 1 flacon : jamais un contaminant
  • Hémoculture encore positive ≥ 48 h ; fièvre ou bactériémie > 72 h : foyer non drainé
  • Souffle nouveau, IC, PR qui s’allonge ou bloc AV (abcès de l’anneau)
  • Embolie, signes neurologiques ; douleur dorsale nouvelle (IRM du rachis)
  • Dispositif intracardiaque, prothèse valvulaire, UDI, début communautaire

✅ À faire maintenant

  • Hémocultures 2 paires avant l’antibiotique, puis ≥ 2 paires à 48 h
  • ETT chez tous ; ETO si risque accru
  • ECG, créatinine, FSC, analyse d’urine ; examen ciblé (rachis, articulations, cathéters, peau)
  • Retirer tout cathéter impliqué ; drainer les abcès

💊 Premières ordonnances

  • Empirique : vancomycine selon nomogramme (charge 25–30 mg/kg, max 3 g) + céfazoline 2 g IV q8h si EI aiguë soupçonnée ; + ceftriaxone 2 g IV q24h (au lieu de la céfazoline) si EI subaiguë ou associée aux soins
  • Germes à couvrir : S. aureus (dont SARM), SCN, streptocoques viridans, Enterococcus spp. ; + HACEK si EI subaiguë
  • SASM : céfazoline 2 g IV q8h
  • SARM : vancomycine IV (charge 25–30 mg/kg, max 3 g, puis entretien selon le nomogramme), cible ASC 400–600 (pharmacie)
  • Durée ≥ 14 jours IV à partir de la 1re hémoculture négative

📞 Appeler ou orienter si

  • Microbiologie médicale et infectiologie : Hémoculture positive à S. aureus ; endocardite soupçonnée ou confirmée ; bactériémie ≥ 48 h ou fièvre > 72 h
  • Cardiologie : Indication chirurgicale d’endocardite ; PR qui s’allonge ou bloc AV
  • Orthopédie : Prothèse articulaire infectée ou arthrite septique
  • Néphrologie : Cathéter de dialyse en cause

Délais, autres situations et quoi préparer : section Consulter ›

🔗 Ressources et raisonnement

📘 Protocoles Antibiothérapie empirique · fiche guides locaux · INESSS — Antibioprophylaxie de l’endocardite infectieuse

📞 Consulter Consulter en infectiologie si : · Urgente : consultation intrahospitalière · semi-urgente : intrahospitalière ou externe · élective : en externe

🧭 Raisonnement clinique Bactériémie à Gram positif

Définition et facteurs de risque

  • Bactériémie à S. aureus (BSA) : toute hémoculture positive (même 1 flacon sur 4).
  • Endocardite infectieuse (EI) : elle complique environ 10–20 % des BSA. Le risque est plus élevé avec un début communautaire, l’utilisation de drogues IV, une prothèse valvulaire ou un dispositif intracardiaque (stimulateur, défibrillateur), un antécédent d’EI ou une valvulopathie, l’hémodialyse et une bactériémie persistante.

⚠️ Recommandation actuelle (IDSA/ESCMID, 2026) : les catégories « compliquée / non compliquée » sont remplacées par une stratification du risque dès le départ. Facteurs clés : début communautaire, hémoculture encore positive ≥ 48 h après la première, dispositif intracardiaque. Autres facteurs : valvulopathie, UDI, greffon endovasculaire, BSA dans les 90 jours, signes d’un foyer, embolies, foyers multiples non contigus, foyer inconnu.

Évaluation

Examen Commentaire
Hémocultures 2 paires avant l’antibiotique Puis ≥ 2 paires à 48 h, ensuite q24–48 h jusqu’à négativation
ETT chez tous les adultes Aucun sous-groupe à « très faible risque » n’en dispense (IDSA/ESCMID 2026)
ETO si ETT négative et facteur de risque accru Dispositif intracardiaque, valvulopathie ou EI antérieure, hémoculture positive ≥ 48 h, embolie, ≥ 2 foyers non contigus. À considérer si début communautaire ou UDI
ECG (puis répéter) Un PR qui s’allonge ou un bloc AV suggère un abcès de l’anneau aortique
Examen ciblé quotidien Rachis (spondylodiscite, abcès épidural), articulations, prothèses, psoas, peau, cathéters, souffle nouveau, signes neurologiques
Imagerie corps entier (TEP-TDM) ou ciblée (TDM thoraco-abdominale, doppler veineux) Si risque accru et foyer inconnu après l’évaluation initiale
Créatinine, FSC, CK si daptomycine, analyse d’urine Suivi de toxicité et d’atteinte rénale (glomérulonéphrite, emboles)

Critères de Duke-ISCVID 2023 (résumé)

Majeurs Mineurs
Microbiologie : S. aureus dans ≥ 2 hémocultures séparées (désormais typique peu importe l’origine communautaire ou nosocomiale) Prédisposition (valvulopathie, UDI, dispositif, EI antérieure)
Imagerie : végétation, abcès, perforation, fistule, nouvelle déhiscence de prothèse (écho, TDM cardiaque) ; TEP-TDM positive sur prothèse Fièvre ≥ 38 °C
Constat chirurgical d’EI Phénomènes vasculaires (emboles, anévrisme mycotique, Janeway) ou immunologiques (Osler, Roth, glomérulonéphrite)
Évidence microbiologique ne répondant pas au critère majeur
  • EI certaine : 2 majeurs, ou 1 majeur + 3 mineurs, ou 5 mineurs. Possible : 1 majeur + 1 mineur, ou 3 mineurs.

Prise en charge

Antibiothérapie (adulte, fonction rénale normale)

Situation Traitement Commentaire
Empirique, EI aiguë soupçonnée (valve native ou prothétique) Vancomycine selon nomogramme (charge 25–30 mg/kg, max 3 g) + céfazoline 2 g IV q8h Alternative : daptomycine 10 mg/kg IV q24h. Germes : Staphylococcus spp., streptocoques viridans, Enterococcus spp.
Empirique, EI subaiguë sur valve native ou associée aux soins (HD, traitement IV < 30 j, hospitalisation < 3 mois) Vancomycine selon nomogramme + ceftriaxone 2 g IV q24h Alternative : daptomycine 10 mg/kg IV q24h + ceftriaxone 2 g IV q24h. Germes : idem + HACEK
Empirique, infection de cathéter Vancomycine selon nomogramme (+ pipéracilline-tazobactam 4 g IV q6h si choc septique) Alternative : daptomycine 6–10 mg/kg IV q24h ou linézolide 600 mg PO bid (IV q12h si PO impossible). Germes : SCN, S. aureus
SASM Céfazoline 2 g IV q8h (q6h utilisé dans SNAP pour EI ou état critique) 1er choix. Atteinte du SNC : avis ID (pénétration méningée incertaine)
SASM, alternative Cloxacilline 2 g IV q4h (guide local) Plus d’IRA ; veine centrale (très irritante) ; pas d’ajustement rénal
SASP (sensible à la pénicilline, test validé par le laboratoire) Pénicilline G IV (p. ex. 3–4 M UI q4h) Moins d’IRA que la cloxacilline (SNAP 2026)
SARM Vancomycine, cible ASC 400–600 (pharmacie) Daptomycine 6–10 mg/kg IV q24h (bactériémie) ou 10 mg/kg IV q24h (EI) si allergie, CMI vanco ≥ 2, échec ou IRA ; poids de dosage si IMC > 30 ; CK hebdomadaire, cesser les statines ; jamais pour une pneumonie
Prothèse valvulaire Antistaphylococcique + rifampicine 300 mg PO q8h × ≥ 6 sem (après négativation des hémocultures) + gentamicine 1 mg/kg IV q8h × 2 sem Toujours avec ID et chirurgie cardiaque

⚠️ Recommandation actuelle (essai SNAP, NEJM et Lancet 2026) : pour le SASM, la céfazoline est non inférieure à la cloxacilline/flucloxacilline sur la mortalité à 90 jours (15 % vs 17 %) et cause moins d’insuffisance rénale aiguë. Pour le SASP, la pénicilline G est à préférer à la cloxacilline. L’ajout routinier de gentamicine ou de rifampicine à une BSA sur valve native n’est pas recommandé (néphrotoxicité, sans bénéfice).

  • Ajuster selon la ClCr : céfazoline (dose usuelle si ClCr ≥ 35), vancomycine (charge selon le poids et la fonction rénale, puis nomogramme), daptomycine (dose usuelle si ClCr ≥ 30) ; suivre le guide local et la pharmacie. Cloxacilline : aucun ajustement rénal.
  • Allergie aux pénicillines : la céfazoline est généralement sécuritaire en cas d’allergie non sévère (chaîne latérale distincte). Si réaction grave, vancomycine ou daptomycine.

Contrôle de la source

  • Retirer tout cathéter vasculaire impliqué (CVC, PICC, Port-a-cath). Ne pas le remplacer avant d’avoir des hémocultures négatives si possible.
  • Drainer les abcès, laver une arthrite septique, consulter l’orthopédie pour une prothèse articulaire.
  • Hémodialyse : avis néphro et ID pour le cathéter tunnellisé (retrait ou changement sur guide).

Endocardite : indications chirurgicales (ESC 2023)

  • Insuffisance cardiaque par régurgitation, obstruction ou fistule.
  • Infection non contrôlée : abcès, pseudo-anévrisme, fistule, végétation qui grossit, hémocultures positives malgré ≥ 1 semaine d’antibiotiques adéquats, EI sur prothèse à S. aureus.
  • Prévention des embolies : végétation ≥ 10 mm avec embolie, ou ≥ 30 mm.
  • Avis précoce de l’équipe d’endocardite et de la chirurgie cardiaque (voir Consulter), même si le patient est instable ou a fait un AVC.

Durée

Situation Durée (à partir de la 1re hémoculture négative ou du contrôle de la source)
Faible risque (ou risque accru avec évaluation négative et bonne évolution) ≥ 14 jours IV
Foyer profond (spondylodiscite, abcès, arthrite), bactériémie persistante 4–6 semaines (ostéomyélite vertébrale ≥ 6 sem)
EI valve native 4–6 semaines
EI sur prothèse ≥ 6 semaines

Relais oral

  • EI du cœur gauche stable (ESC 2023, essai POET) : relais par une association orale de 2 antibiotiques possible après ≥ 10 jours IV (dont ≥ 7 jours après une chirurgie). Il faut une hémoculture négative, l’absence d’abcès et une ETO de contrôle. Toujours avec ID.
  • BSA sans EI : le relais oral précoce reste à l’étude (domaine « relais oral » de SNAP, résultats en attente). Ne pas l’entreprendre sans ID.
  • La dalbavancine (2 doses à 1 sem d’intervalle, essai DOTS) est une option émergente pour les patients chez qui une voie IV prolongée est problématique (p. ex. UDI). À discuter avec ID.

Consulter

Consulter en infectiologie si :

Toute bactériémie à S. aureus : consultation en infectiologie systématique (mortalité réduite).

  • UrgentHémoculture positive à S. aureus (même 1 flacon) — garde, même jour.
  • UrgentEndocardite soupçonnée ou confirmée — garde, même jour.
  • UrgentBactériémie ≥ 48 h ou fièvre > 72 h (foyer non drainé) — garde, même jour.
  • Semi-urgentRelais oral ou dalbavancine envisagés — pendant le séjour, jamais sans avis.

À préparer : dates et nombre d’hémocultures positives, 1re hémoculture négative, antibiogramme (SASM, SARM, SASP), ETT/ETO, ECG (PR), dispositifs et cathéters, foyers trouvés, créatinine, UDI.

Consulter en cardiologie si :

  • UrgentIndication chirurgicale d’endocardite (IC, infection non contrôlée, végétation ≥ 10 mm avec embolie, prothèse) — garde, même jour ; avec la chirurgie cardiaque.
  • UrgentPR qui s’allonge ou bloc AV (abcès de l’anneau) — garde, même jour.
  • Semi-urgentAtteinte aortique ou mitrale sévère résiduelle (après EI) — ≤ 28 jours.

Consulter en orthopédie si :

  • UrgentProthèse articulaire infectée ou arthrite septique — garde, même jour.

Consulter en néphrologie si :

  • UrgentCathéter de dialyse en cause (retrait ou changement sur guide, avec l’infectiologie) — même jour.

Consulter le pharmacien si :

  • Semi-urgentVancomycine : cible ASC 400–600 (et ajustement rénal de la céfazoline ou de la daptomycine) — pendant le séjour.

Algorithme

SASM

SARM

Non, ETT normale,
hémocultures négatives,
défervescence

Oui

Négatif et
bonne évolution

EI ou foyer profond

Hémoculture positive
à S. aureus

Vancomycine empirique
± céfazoline si EI soupçonnée
Consultation infectiologie

Retirer cathéters, drainer abcès
Hémocultures à 48 h
ETT chez tous

Antibiogramme

Céfazoline 2 g IV q8h
(pénicilline G si SASP confirmé)

Vancomycine ASC 400-600
ou daptomycine

Facteurs de risque accrus ?
Hémoculture + à 48 h, dispositif,
communautaire, embolie, UDI

Risque faible :
14 jours IV à partir de
la 1re hémoculture négative

ETO ± TEP-TDM
ou imagerie ciblée

4-6 semaines
Évaluer la chirurgie cardiaque
ou le drainage

Suivi et congé

  • Hémocultures jusqu’à négativation documentée ; on compte la durée à partir de la 1re négative.
  • Antibiothérapie intraveineuse ambulatoire (CLSC) avec PICC, une fois les hémocultures négatives et la source contrôlée.
  • Pendant le traitement : FSC, créatinine, bilan hépatique hebdomadaires ; CK si daptomycine ; niveaux ou ASC de vancomycine.
  • Revoir à la fin du traitement et à 4–12 semaines pour dépister une rechute (fièvre, douleur dorsale) ; hémocultures au moindre doute.
  • UDI : offrir un traitement par agonistes opioïdes, la naloxone et du matériel stérile pendant l’hospitalisation (voir la fiche Opioïdes, méthadone et TUO).
  • EI : antibioprophylaxie dentaire à vie (fiche INESSS), suivi dentaire et cardiologique.

Pièges et perles

  • Un seul flacon positif à S. aureus : on traite et on investigue. Ce n’est pas un staphylocoque coagulase négative.
  • Fièvre ou bactériémie qui persiste > 72 h : il y a un foyer non drainé (rachis, psoas, thrombophlébite septique, prothèse) jusqu’à preuve du contraire.
  • La vancomycine est inférieure à la céfazoline ou à la cloxacilline pour le SASM : passer à la bêta-lactamine dès l’antibiogramme.
  • Douleur dorsale nouvelle sous traitement : IRM du rachis.
  • La consultation en infectiologie réduit la mortalité d’environ 50 % dans les études observationnelles : on la demande systématiquement.
  • Un ETT de bonne qualité négatif n’exclut pas une EI chez un patient porteur de dispositif ou de prothèse : ETO.

Voir aussi

Références

🔗 Voir aussi